Sekwencjonowanie i analiza genomowego DNA i cDNA kodującego TNF-alfa u małpy wiewiórki (Saimiri sciureus)
Julian
- 0
Jeśli szereg cytokin i czynników wzrostu, które zostały scharakteryzowane z komórek ludzkich, zbadano na naczelnych innych niż ludzie, wyniki takich podejść umożliwiłyby opracowanie testów do wykrywania i ilościowego oznaczania cytokin w modelach eksperymentalnych. Czynnik martwicy nowotworu-alfa (TNF-alfa) jest ważną pluripotencjalną cytokiną, która odgrywa kluczową rolę w obronie gospodarza. Jak dotąd nie doniesiono o pełnych danych molekularnych dla TNF-alfa małpy wiewiórki. Startery do łańcuchowej reakcji polimerazy (PCR) zastosowano do śledzenia intronów, porównując rozmiary produktów otrzymanych przy użyciu cDNA i genomowego DNA jako matryc.
Genomowy DNA składa się z czterech eksonów i trzech intronów z 1793 nukleotydami. Odpowiadający mu cDNA składa się z 702 nukleotydów, a analiza filogenetyczna wykazała, że Saimiri sciureus był najbliżej spokrewniony z rodzajem Aotus, naczelnym nowego świata, w porównaniu z naczelnymi ze starego świata (rodzaj Macaca i Papio). Wydedukowane białko TNF-alfa składa się z 233 aminokwasów, które są w 82% identyczne z człowiekiem, 95% z małpami z nowego świata i 79% z małpami ze starego świata. Sklonowany cDNA TNF-alfa będzie przydatny do ilościowego oznaczania TNF-alfa na poziomie mRNA.
Przezłożyskowa ekspozycja na cisplatynę wywołuje trwałe uszkodzenia mitochondrialnego i genomowego DNA płodu u małp patas .
W poprzedniej próbie modelowania przezłożyskowej ekspozycji na cisplatynę i genotoksyczności wykorzystano kilka ciężarnych małp Erythrocebus patas; większość zwierząt była eksponowana pod koniec ciąży, a analizy adduktów cisplatyny-DNA obejmowały tylko genomowy DNA. Tutaj określono tworzenie adduktów genomowego i mitochondrialnego DNA u płodów dwóch ciężarnych małp wystawionych na działanie pod koniec drugiego trymestru ciąży. Mnogie tkanki płodowe uzyskano po podaniu dawek 0,315 mg cisplatyny/kg masy ciała (łącznie 5,3 mg/m2) w 101. i 106. dniu ciąży.
Cięcia cesarskie wykonano 24 godziny po ekspozycji i 27 dni po ekspozycji. Addukty genomowego (g)-DNA cisplatyny obserwowano w nadnerczach płodu, mózgu, sercu, nerkach, wątrobie, skórze, śledzionie i grasicy. Gdy łożyska dwóch zwierząt podzielono na cztery koncentryczne regiony w coraz większych odległościach od pępowiny i oznaczono g-DNA, poziomy adduktów cisplatyny DNA były podobne we wszystkich czterech regionach.
Addukty mitochondrialne (mt)-DNA były wyższe niż addukty g-DNA w wątrobie matki i wątrobie, mózgu i nerkach płodu, co sugeruje, że mitochondria mogą stanowić szczególny cel dla genotoksyczności cisplatyny. Badanie wykazuje znaczną genotoksyczność płodu w g-DNA i mt-DNA małp patas narażonych na cisplatynę w macicy, co sugeruje, że podobnie eksponowane ludzkie płody mogą również doznawać uszkodzeń DNA wywołanych przez leki.
Wpływ DNA – uszkadzanie enediyny C-1027 na wewnątrzkomórkowe SV40 i genomowe DNA w komórkach BSC-1 nerki zielonej małpy
Badanie to opisuje selektywną zdolność C-1027 do indukowania ograniczonych uszkodzeń dwuniciowych w docelowym wirusowym DNA. Wpływ środowiska komórkowego na aktywność C-1027 zbadano przez oznaczenie zakresu, a także specyficzności uszkodzenia DNA wirusa małpiego 40 (SV40) w zakażonych litycznie komórkach BSC-1 ssaków oraz w oczyszczonych preparatach DNA SV40 . Uszkodzenie C-1027 wewnątrzkomórkowego DNA SV40 oszacowano ilościowo za pomocą topologicznej analizy konwersji postaci. Przy stężeniach C-1027 od 2 do 100 nM zaobserwowano stopniowy spadek wewnątrzkomórkowej superskręconej postaci I, któremu towarzyszył wzrost postaci III, przy 50% zmniejszeniu postaci I przy 50 nM. Uszkodzenie oczyszczonego DNA SV40 również było najbardziej wyraźne między 10 a 100 nM C-1027.

Gdy stężenia wyrażono jako wartości r (stosunek molowy lek/DNA), ilość C-1027 niezbędna do uzyskania 50% redukcji postaci I była niższa dla wewnątrzkomórkowego (r = 0,002) niż dla oczyszczonego DNA SV40 (r = 0,0035) . Uszkodzenie dwuniciowe było bardziej prawdopodobne przy traktowaniu C-1027 wewnątrzkomórkowego w porównaniu z oczyszczonym DNA SV40. Jednak zarówno w przypadku oczyszczonego, jak i wewnątrzkomórkowego DNA, analiza trawienia enzymami restrykcyjnymi wykazała uszkodzenia dwuniciowe w wielu określonych miejscach w całym genomie , szczególnie we wczesnym regionie genomu SV40 (np. w sekwencji kodującej duży antygen T) .
Nie zaobserwowano żadnych znaczących uszkodzeń ani w regionach początkowych (ORI) ani terminacji (TER) replikacji SV40. Zakres uszkodzenia C-1027 w DNA niezainfekowanych komórek BSC-1 był również określany ilościowo przy użyciu elektroforezy żelowej w polu pulsacyjnym. Przy 0,1 nM (r = 2,8 x 10(-5), gdzie włączanie [3H]tymidyny zostało zmniejszone o 80%, w niezainfekowanych komórkach BSC-1 wykryto 600 rad równoważnika uszkodzenia. Przy wartościach C-1027 r od 1 x 10(-4) do 40 x 10(-4), dwuniciowe pęknięcia były od 80 do 40-krotnie częstsze w genomowym DNA SV40 niż w komórce BSC-1. hamują akumulację wewnątrzkomórkowego DNA SV40 w porównaniu z inkorporacją [3H]tymidyny do niezainfekowanych komórek BSC-1 Tak więc synteza DNA SV40 wydaje się być mniej wrażliwa na zmiany indukowane przez C-1027 niż replikacja w niezainfekowanych komórkach BSC-1.
Organizacja genomowa sekwencji o niskiej liczbie kopii, które są związane z deka-satelitarnym DNA w genomie małpy
Wcześniej opisany segment DNA afrykańskiej małpy zielonej (sklonowany w fagu lambda MkA) zawiera dekasatelitę połączony z sekwencjami DNA, które, jak się szacuje, występują raz na genom. Sekwencje homologiczne do sekwencji o małej liczbie kopii w lambda MkA są również związane ze specyficznymi gatunkowo satelitarnymi DNA w genomach człowieka i myszy . Drugi klon, lambda Mk8, zawiera region DNA małpy, który jest współliniowy i homologiczny do części sekwencji o małej liczbie kopii w lambda MkA, ale nie zawiera sekwencji satelitarnych .
Dwa sklonowane segmenty znacznie się różnią, zaczynając od punktu znajdującego się w pobliżu satelitarnego regionu DNA w lambda MkA. Eksperymenty z blottingiem DNA wskazują, że lambda Mk8, ale nie lambda MkA, reprezentuje typową organizację genomową i że segmenty o niskiej liczbie kopii występują tylko raz na genom haploidalny. Dane sugerują, że rearanżacje, takie jak delecje lub inwersje zachodzące w komórkach małp, częściowo odpowiadają za strukturę lambda MkA. Dodatkowe rearanżacje mogły wystąpić podczas klonowania w E. coli. Ten unikalny region chromosomalny może być szczególnie podatny na rekombinację.
Częściowa struktura genu filoksyny z olbrzymiej żaby małpiej Phyllomedusa bicolor: równoległe klonowanie prekursorowego DNA c i genomowego DNA z liofilizowanej wydzieliny skórnej.
Phyloxin to nowy prototypowy peptyd przeciwdrobnoustrojowy ze skóry Phyllomedusa bicolor. W tym miejscu opisujemy równoległą identyfikację i sekwencjonowanie transkryptu prekursora filoksyny (mRNA) i częściowej struktury genu (genomowego DNA) z tej samej próbki liofilizowanej wydzieliny skóry przy użyciu naszej niedawno opisanej techniki klonowania.
Control Genomic DNA - Rhesus Monkey Male |
|||
D1534999-G01 | Biochain | 100 ug | 170 EUR |
Control Genomic DNA - Rhesus Monkey Female |
|||
D1534999-G02 | Biochain | 100 ug | 170 EUR |
Human Brain Genomic DNA |
|||
X11001 | EpiGentek |
|
|
cDNA - Monkey (Rhesus) Normal Tissue: Brain |
|||
C1534035 | Biochain | 40 reactions | 385 EUR |
Genomic DNA - Rat Normal Tissue: Brain |
|||
D1434035 | Biochain | 100 ug | 286 EUR |
Total RNA - Monkey (Rhesus) Normal Tissue: Brain |
|||
R1534035-50 | Biochain | 50 ug | 191 EUR |
Genomic DNA - Mouse Normal Tissue: Brain |
|||
D1334035 | Biochain | 100 ug | 286 EUR |
Monkey (Rhesus) Normal Brain Whole tissue lysate |
|||
MRL-1272 | Alpha Diagnostics | 1 mg | 628.8 EUR |
Membrane Protein - Monkey (Rhesus) Normal Tissue: Brain |
|||
P3534035 | Biochain | 0.1 mg | 270 EUR |
Control Genomic DNA - Cynomolgus Monkey Male |
|||
D1534999-Cy-G01 | Biochain | 100 ug | 170 EUR |
Control Genomic DNA - Cynomolgus Monkey Female |
|||
D1534999-Cy-G02 | Biochain | 100 ug | 170 EUR |
Genomic DNA - Dementia: Brain: Thalamus, from a single donor |
|||
D1236079Dem | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Alzheimer's Disease: Brain, from a single donor |
|||
D1236035Alz | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Parkinson's Disease: Brain, from a single donor |
|||
D1236035Par | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Depression: Brain: Thalamus, from a single donor |
|||
D1236079Dep | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Monkey (Rhesus) Methylated DNA Control |
|||
D6534149 | Biochain | 5 ug | Ask for price |
Genomic DNA - Dementia: Brain: Frontal Lobe, from a single donor |
|||
D1236051Dem | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Dementia: Brain: Parietal Lobe, from a single donor |
|||
D1236066Dem | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Alzheimer's Disease: Brain: Pons, from a single donor |
|||
D1236071Alz | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Parkinson's Disease: Brain: Pons, from a single donor |
|||
D1236071Par | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Dementia: Brain: Temporal Lobe, from a single donor |
|||
D1236078Dem | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Depression: Brain: Frontal Lobe, from a single donor |
|||
D1236051Dep | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Dementia: Brain: Occipital Lobe, from a single donor |
|||
D1236062Dem | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Depression: Brain: Parietal Lobe, from a single donor |
|||
D1236066Dep | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Depression: Brain: Temporal Lobe, from a single donor |
|||
D1236078Dep | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Depression: Brain: Occipital Lobe, from a single donor |
|||
D1236062Dep | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Alzheimer's Disease: Brain: Thalamus, from a single donor |
|||
D1236079Alz | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Parkinson's Disease: Brain: Thalamus, from a single donor |
|||
D1236079Par | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Multiple Sclerosis Disease: Brain, from a single donor |
|||
D1236035Msc | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Human Adult Normal Tissue: Brain, from a single donor |
|||
D1234035 | Biochain | 100 ug | 286 EUR |
Genomic DNA - Alzheimer's Disease: Brain: Cerebellum, from a single donor |
|||
D1236039Alz | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Parkinson's Disease: Brain: Cerebellum, from a single donor |
|||
D1236039Par | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Human Diabetic Diseased Tissue: Brain, from a single donor |
|||
D1236035Dia | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Alzheimer's Disease: Brain: Frontal Lobe, from a single donor |
|||
D1236051Alz | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Parkinson's Disease: Brain: Frontal Lobe, from a single donor |
|||
D1236051Par | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Alzheimer's Disease: Brain: Parietal Lobe, from a single donor |
|||
D1236066Alz | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Parkinson's Disease: Brain: Parietal Lobe, from a single donor |
|||
D1236066Par | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Multiple Sclerosis Disease: Brain: Pons, from a single donor |
|||
D1236071Msc | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Alzheimer's Disease: Brain: Temporal Lobe, from a single donor |
|||
D1236078Alz | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Parkinson's Disease: Brain: Temporal Lobe, from a single donor |
|||
D1236078Par | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Alzheimer's Disease: Brain: Occipital Lobe, from a single donor |
|||
D1236062Alz | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Parkinson's Disease: Brain: Occipital Lobe, from a single donor |
|||
D1236062Par | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Alzheimer's Disease: Brain: Precentral Gyrus , from a single donor |
|||
D1236073Alz | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Parkinson's Disease: Brain: Precentral Gyrus, from a single donor |
|||
D1236073Par | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Alzheimer's Disease: Brain: Corpus Callosum, from a single donor |
|||
D1236045Alz | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Parkinson's Disease: Brain: Corpus Callosum, from a single donor |
|||
D1236045Par | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Progressive Supranuclear Palsy: Brain: Pons, from a single donor |
|||
D1236071PSP | Biochain | 50 ug | 576 EUR |
Genomic DNA - Alzheimer's Disease: Brain: Postcentral Gyrus , from a single donor |
|||
D1236072Alz | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Parkinson's Disease: Brain: Postcentral Gyrus, from a single donor |
|||
D1236072Par | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Multiple Sclerosis Disease: Brain: Thalamus, from a single donor |
|||
D1236079Msc | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Multiple Sclerosis Disease: Brain: Amygdala, from a single donor |
|||
D1236036Msc | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Alzheimer's Disease: Brain: Medulla oblongata, from a single donor |
|||
D1236057Alz | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Parkinson's Disease: Brain: Medulla oblongata, from a single donor |
|||
D1236057Par | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Multiple Sclerosis Disease: Brain: Cerebellum, from a single donor |
|||
D1236039Msc | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Multiple Sclerosis Disease: Brain: Frontal Lobe, from a single donor |
|||
D1236051Msc | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Progressive Supranuclear Palsy: Brain: Cerebellum, from a single donor |
|||
D1236039PSP | Biochain | 50 ug | 576 EUR |
Genomic DNA - Multiple Sclerosis Disease: Brain: Parietal Lobe, from a single donor |
|||
D1236066Msc | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Multiple Sclerosis Disease: Brain: Temporal Lobe, from a single donor |
|||
D1236078Msc | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Multiple Sclerosis Disease: Brain: Occipital Lobe, from a single donor |
|||
D1236062Msc | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Human Adult Normal Tissue: Brain, occipital lobe, from a single donor |
|||
D1234062 | Biochain | 100 ug | 286 EUR |
Genomic DNA - Multiple Sclerosis Disease: Brain: Precentral Gyrus, from a single donor |
|||
D1236073Msc | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Progressive Supranuclear Palsy: Brain: Frontal Lobe, from a single donor |
|||
D1236051PSP | Biochain | 50 ug | 576 EUR |
Genomic DNA - Progressive Supranuclear Palsy: Brain: Occipital Lobe, from a single donor |
|||
D1236062PSP | Biochain | 50 ug | 576 EUR |
Genomic DNA - Progressive Supranuclear Palsy: Brain: Parietal Lobe, from a single donor |
|||
D1236066PSP | Biochain | 50 ug | 576 EUR |
Genomic DNA - Multiple Sclerosis Disease: Brain: Postcentral Gyrus, from a single donor |
|||
D1236072Msc | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Progressive Supranuclear Palsy: Brain: Temporal Lobe, from a single donor |
|||
D1236078PSP | Biochain | 50 ug | 576 EUR |
Genomic DNA - Multiple Sclerosis Disease: Brain: Medulla oblongata, from a single donor |
|||
D1236057MSC | Biochain | 50 ug | 489 EUR |
Genomic DNA - Progressive Supranuclear Palsy: Brain: Medulla oblongata, from a single donor |
|||
D1236057PSP | Biochain | 50 ug | 576 EUR |
Genomic DNA Kit |
|||
20-abx098076 | Abbexa |
|
|
Human Genomic DNA |
|||
BIO-35025 | Bioline | 500µl @ 200ng/µl | Ask for price |
Human Genomic DNA |
|||
X11000 | EpiGentek |
|
|
SAA1, monkey (rhesus macaque) |
|||
RC326-12 | Bio Basic | 2ug | 125.26 EUR |
Soil Genomic DNA Kit |
|||
K1411-250 | Biovision | each | 673.2 EUR |
Soil Genomic DNA Kit |
|||
K1411-50 | Biovision | each | 379.2 EUR |
Rhesus Monkey Adipose Lysate |
|||
21-266 | ProSci | 0.1 mg | 468.6 EUR |
Plant Genomic DNA Kit |
|||
20-abx098077 | Abbexa |
|
|
Micro Genomic DNA Kit |
|||
20-abx098242 | Abbexa |
|
|
Blood Genomic DNA Kit |
|||
abx098868-50rxns | Abbexa | 50 rxns | 326.4 EUR |
Plant Genomic DNA Kit |
|||
abx294004-50preps | Abbexa | 50 preps | 477.6 EUR |
Yeast Genomic DNA Kit |
|||
K1414-250 | Biovision | each | 673.2 EUR |
Yeast Genomic DNA Kit |
|||
K1414-50 | Biovision | each | 379.2 EUR |
Animal Genomic DNA Kit |
|||
abx294005-100preps | Abbexa | 100 preps | 627.6 EUR |
Animal Genomic DNA Kit |
|||
abx294005-50preps | Abbexa | 50 preps | 477.6 EUR |
Insect Genomic DNA Kit |
|||
K1412-250 | Biovision | each | 673.2 EUR |
Insect Genomic DNA Kit |
|||
K1412-50 | Biovision | each | 379.2 EUR |
Fungal Genomic DNA Kit |
|||
K1415-250 | Biovision | each | 673.2 EUR |
Fungal Genomic DNA Kit |
|||
K1415-50 | Biovision | each | 379.2 EUR |
Mollusc Genomic DNA Kit |
|||
K1413-250 | Biovision | each | 673.2 EUR |
Mollusc Genomic DNA Kit |
|||
K1413-50 | Biovision | each | 379.2 EUR |
Bacteria Genomic DNA Kit |
|||
20-abx098080 | Abbexa |
|
|
Monkey (Rhesus) cDNA Tissue: Thyroid |
|||
MR34-265 | Alpha Diagnostics | 10 rxn | 498 EUR |
Genomic DNA Isolation Kit |
|||
55R-1362 | Fitzgerald | 50 assays | 462 EUR |
Genomic DNA Isolation Kit |
|||
K281-50 | Biovision | each | 326.4 EUR |
Genomic DNA Isolation Kit |
|||
K2118-50 | ApexBio | 50 assays | 385.2 EUR |
Rabbit anti Rhesus Monkey IgG |
|||
FNSA-0092 | FN Test | 500 uL | 367.92 EUR |
Rabbit anti Rhesus Monkey IgM |
|||
FNSA-0093 | FN Test | 500 uL | 367.92 EUR |
Non-sterile Rhesus monkey serum |
|||
RMS05-0050 | Equitech | 50 ml | 889.2 EUR |
Non-sterile Rhesus monkey serum |
|||
RMS05-0100 | Equitech | 100 ml | 1368.12 EUR |
Non-sterile Rhesus monkey serum |
|||
RMS05-0500 | Equitech | 500 ml | Ask for price |
ISOLATE II Genomic DNA Kit |
|||
BIO-52065 | Bioline | 10 preps | Ask for price |
×
- Otwarta ramka odczytu prekursora filoksyny była identyczna pod względem sekwencji nukleotydowej z poprzednio opisaną, a dopasowanie do sekwencji nukleotydowej pochodzącej z genomowego DNA wskazywało na obecność intronu o wielkości 175 pz zlokalizowanego w niemal identycznej pozycji, jak w dermaseptynach.
- Wysoce konserwatywna strukturalna organizacja genów peptydów wydzielniczych skóry u P. bicolor może zatem zostać rozszerzona o gen kodujący filoksynę (plx).
- Dane te dodatkowo wzmacniają nasze twierdzenie, że zastosowanie opisanej metodologii może dostarczyć solidnych danych genomicznych/transkryptomicznych/peptydomicznych bez konieczności uśmiercania próbek.
Tagi: monoclonal monoclonal antibodies monoclonal antibody infusion monoclonal antibody infusion near me monoclonal antibody sequence database monoclonal antibody therapy monoclonal antibody therapy near me monoclonal antibody treatment florida monoclonal antibody treatment for covid-19 monoclonal antibody treatment locations monoclonal antibody treatment near me monoclonal gammopathy monoclonal infusion monoclonal polyclonal monoclonal protein